Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn3P58391 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn3P58391 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnn3P58391 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnn3P58391 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnn3P58391 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnn3P58391 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnn3P58391 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnn3P58391 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnn3P58391 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnn3P58391 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnn3P58391 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnn3P58391 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnn3P58391 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnn3P58391 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn3P58391 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn3P58391 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnn3P58391 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnn3P58391 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn3P58391 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnn3P58391 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnn3P58391 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnn3P58391 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnn3P58391 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnn3P58391 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnn3P58391 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnn3P58391 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnn3P58391 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnn3P58391 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnn3P58391 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnn3P58391 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnn3P58391 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnn3P58391 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnn3P58391 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnn3P58391 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnn3P58391 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnn3P58391 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnn3P58391 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnn3P58391 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnn3P58391 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnn3P58391 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnn3P58391 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnn3P58391 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnn3P58391 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnn3P58391 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnn3P58391 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnn3P58391 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnn3P58391 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnn3P58391 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnn3P58391 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnn3P58391 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnn3P58391 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnn3P58391 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn3P58391 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn3P58391 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn3P58391 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn3P58391 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn3P58391 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn3P58391 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn3P58391 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn3P58391 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn3P58391 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnn3P58391 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnn3P58391 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnn3P58391 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnn3P58391 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms