Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Opa1P58281 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Opa1P58281 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Opa1P58281 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Opa1P58281 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Opa1P58281 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Opa1P58281 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Opa1P58281 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Opa1P58281 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Opa1P58281 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Opa1P58281 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Opa1P58281 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Opa1P58281 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Opa1P58281 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Opa1P58281 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Opa1P58281 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Opa1P58281 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Opa1P58281 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Opa1P58281 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Opa1P58281 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Opa1P58281 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Opa1P58281 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Opa1P58281 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Opa1P58281 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Opa1P58281 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Opa1P58281 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Opa1P58281 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Opa1P58281 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Opa1P58281 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Opa1P58281 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Opa1P58281 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Opa1P58281 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Opa1P58281 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Opa1P58281 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Opa1P58281 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Opa1P58281 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Opa1P58281 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Opa1P58281 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Opa1P58281 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Opa1P58281 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Opa1P58281 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Opa1P58281 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Opa1P58281 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Opa1P58281 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Opa1P58281 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Opa1P58281 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Opa1P58281 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Opa1P58281 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Opa1P58281 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Opa1P58281 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Opa1P58281 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Opa1P58281 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Opa1P58281 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Opa1P58281 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Opa1P58281 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Opa1P58281 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Opa1P58281 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Opa1P58281 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Opa1P58281 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Opa1P58281 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Opa1P58281 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Opa1P58281 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Opa1P58281 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Opa1P58281 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Opa1P58281 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Opa1P58281 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Opa1P58281 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Opa1P58281 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Opa1P58281 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Opa1P58281 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Opa1P58281 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Opa1P58281 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Opa1P58281 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Opa1P58281 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Opa1P58281 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Opa1P58281 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Opa1P58281 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Opa1P58281 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Opa1P58281 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Opa1P58281 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Opa1P58281 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Opa1P58281 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Opa1P58281 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Opa1P58281 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Opa1P58281 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Opa1P58281 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Opa1P58281 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Opa1P58281 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Opa1P58281 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Opa1P58281 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Opa1P58281 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Opa1P58281 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Opa1P58281 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Opa1P58281 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms