Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdh5P55284 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh5P55284 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh5P55284 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh5P55284 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdh5P55284 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh5P55284 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh5P55284 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh5P55284 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh5P55284 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh5P55284 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdh5P55284 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh5P55284 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh5P55284 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh5P55284 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh5P55284 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh5P55284 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh5P55284 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh5P55284 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh5P55284 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh5P55284 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh5P55284 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh5P55284 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh5P55284 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh5P55284 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh5P55284 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh5P55284 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh5P55284 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh5P55284 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh5P55284 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh5P55284 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdh5P55284 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdh5P55284 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh5P55284 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh5P55284 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdh5P55284 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdh5P55284 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh5P55284 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh5P55284 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh5P55284 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh5P55284 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdh5P55284 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdh5P55284 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh5P55284 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdh5P55284 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdh5P55284 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh5P55284 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh5P55284 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh5P55284 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh5P55284 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdh5P55284 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh5P55284 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh5P55284 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh5P55284 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh5P55284 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh5P55284 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh5P55284 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh5P55284 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh5P55284 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh5P55284 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh5P55284 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh5P55284 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh5P55284 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh5P55284 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh5P55284 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh5P55284 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh5P55284 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh5P55284 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh5P55284 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh5P55284 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh5P55284 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh5P55284 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh5P55284 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh5P55284 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh5P55284 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh5P55284 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh5P55284 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh5P55284 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh5P55284 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh5P55284 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh5P55284 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh5P55284 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh5P55284 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh5P55284 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh5P55284 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh5P55284 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms