Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PitpnbP53811 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PitpnbP53811 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PitpnbP53811 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PitpnbP53811 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PitpnbP53811 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PitpnbP53811 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PitpnbP53811 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PitpnbP53811 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PitpnbP53811 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PitpnbP53811 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PitpnbP53811 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PitpnbP53811 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PitpnbP53811 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PitpnbP53811 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PitpnbP53811 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PitpnbP53811 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PitpnbP53811 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PitpnbP53811 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PitpnbP53811 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PitpnbP53811 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PitpnbP53811 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PitpnbP53811 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PitpnbP53811 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PitpnbP53811 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PitpnbP53811 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PitpnbP53811 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PitpnbP53811 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PitpnbP53811 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PitpnbP53811 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PitpnbP53811 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PitpnbP53811 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PitpnbP53811 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PitpnbP53811 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PitpnbP53811 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PitpnbP53811 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PitpnbP53811 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PitpnbP53811 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PitpnbP53811 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PitpnbP53811 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PitpnbP53811 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PitpnbP53811 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PitpnbP53811 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PitpnbP53811 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PitpnbP53811 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PitpnbP53811 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PitpnbP53811 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PitpnbP53811 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PitpnbP53811 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PitpnbP53811 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PitpnbP53811 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PitpnbP53811 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PitpnbP53811 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PitpnbP53811 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PitpnbP53811 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PitpnbP53811 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PitpnbP53811 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PitpnbP53811 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PitpnbP53811 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PitpnbP53811 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PitpnbP53811 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PitpnbP53811 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PitpnbP53811 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PitpnbP53811 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PitpnbP53811 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PitpnbP53811 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PitpnbP53811 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PitpnbP53811 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PitpnbP53811 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PitpnbP53811 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PitpnbP53811 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms