Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fdft1P53798 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fdft1P53798 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fdft1P53798 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fdft1P53798 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fdft1P53798 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fdft1P53798 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fdft1P53798 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fdft1P53798 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fdft1P53798 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fdft1P53798 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fdft1P53798 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fdft1P53798 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fdft1P53798 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fdft1P53798 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fdft1P53798 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fdft1P53798 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fdft1P53798 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fdft1P53798 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fdft1P53798 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fdft1P53798 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fdft1P53798 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fdft1P53798 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fdft1P53798 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fdft1P53798 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fdft1P53798 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fdft1P53798 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fdft1P53798 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fdft1P53798 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fdft1P53798 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fdft1P53798 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fdft1P53798 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fdft1P53798 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fdft1P53798 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fdft1P53798 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fdft1P53798 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fdft1P53798 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fdft1P53798 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fdft1P53798 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fdft1P53798 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fdft1P53798 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fdft1P53798 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fdft1P53798 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fdft1P53798 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fdft1P53798 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fdft1P53798 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fdft1P53798 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fdft1P53798 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fdft1P53798 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fdft1P53798 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fdft1P53798 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fdft1P53798 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fdft1P53798 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fdft1P53798 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fdft1P53798 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fdft1P53798 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fdft1P53798 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fdft1P53798 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fdft1P53798 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fdft1P53798 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fdft1P53798 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fdft1P53798 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fdft1P53798 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fdft1P53798 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fdft1P53798 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms