Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CntfP51642 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CntfP51642 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CntfP51642 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CntfP51642 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CntfP51642 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CntfP51642 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CntfP51642 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CntfP51642 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CntfP51642 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CntfP51642 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CntfP51642 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CntfP51642 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CntfP51642 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CntfP51642 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CntfP51642 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CntfP51642 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CntfP51642 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CntfP51642 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CntfP51642 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CntfP51642 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CntfP51642 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CntfP51642 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CntfP51642 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CntfP51642 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CntfP51642 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CntfP51642 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CntfP51642 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CntfP51642 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CntfP51642 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CntfP51642 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CntfP51642 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CntfP51642 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CntfP51642 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CntfP51642 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CntfP51642 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CntfP51642 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CntfP51642 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CntfP51642 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CntfP51642 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CntfP51642 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CntfP51642 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CntfP51642 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CntfP51642 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CntfP51642 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CntfP51642 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CntfP51642 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CntfP51642 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CntfP51642 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CntfP51642 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CntfP51642 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CntfP51642 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CntfP51642 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CntfP51642 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CntfP51642 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CntfP51642 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CntfP51642 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CntfP51642 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntfP51642 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntfP51642 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntfP51642 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CntfP51642 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CntfP51642 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CntfP51642 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CntfP51642 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CntfP51642 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CntfP51642 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CntfP51642 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CntfP51642 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CntfP51642 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CntfP51642 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CntfP51642 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CntfP51642 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CntfP51642 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CntfP51642 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CntfP51642 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CntfP51642 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CntfP51642 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntfP51642 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntfP51642 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CntfP51642 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CntfP51642 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CntfP51642 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CntfP51642 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CntfP51642 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CntfP51642 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CntfP51642 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CntfP51642 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CntfP51642 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CntfP51642 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CntfP51642 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CntfP51642 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CntfP51642 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntfP51642 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntfP51642 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CntfP51642 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CntfP51642 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CntfP51642 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CntfP51642 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CntfP51642 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms