Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
XpcP51612 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
XpcP51612 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
XpcP51612 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
XpcP51612 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
XpcP51612 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
XpcP51612 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
XpcP51612 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
XpcP51612 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
XpcP51612 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
XpcP51612 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
XpcP51612 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
XpcP51612 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
XpcP51612 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
XpcP51612 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
XpcP51612 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
XpcP51612 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
XpcP51612 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XpcP51612 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
XpcP51612 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XpcP51612 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
XpcP51612 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
XpcP51612 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
XpcP51612 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
XpcP51612 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
XpcP51612 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
XpcP51612 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
XpcP51612 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
XpcP51612 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
XpcP51612 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
XpcP51612 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
XpcP51612 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
XpcP51612 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
XpcP51612 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
XpcP51612 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
XpcP51612 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
XpcP51612 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
XpcP51612 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XpcP51612 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
XpcP51612 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
XpcP51612 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
XpcP51612 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
XpcP51612 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
XpcP51612 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XpcP51612 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XpcP51612 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
XpcP51612 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
XpcP51612 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
XpcP51612 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
XpcP51612 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
XpcP51612 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
XpcP51612 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
XpcP51612 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
XpcP51612 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
XpcP51612 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
XpcP51612 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
XpcP51612 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
XpcP51612 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
XpcP51612 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
XpcP51612 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
XpcP51612 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
XpcP51612 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
XpcP51612 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
XpcP51612 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
XpcP51612 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
XpcP51612 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
XpcP51612 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
XpcP51612 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
XpcP51612 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
XpcP51612 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
XpcP51612 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
XpcP51612 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
XpcP51612 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XpcP51612 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
XpcP51612 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XpcP51612 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
XpcP51612 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
XpcP51612 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
XpcP51612 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
XpcP51612 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
XpcP51612 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
XpcP51612 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
XpcP51612 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
XpcP51612 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
XpcP51612 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
XpcP51612 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
XpcP51612 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
XpcP51612 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
XpcP51612 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
XpcP51612 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33■■■□□ 2.87
XpcP51612 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
XpcP51612 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
XpcP51612 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
XpcP51612 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
XpcP51612 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
XpcP51612 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
XpcP51612 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
XpcP51612 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
XpcP51612 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
XpcP51612 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms