Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa13P50711 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Defa13P50711 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa13P50711 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa13P50711 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa13P50711 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa13P50711 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa13P50711 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa13P50711 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa13P50711 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa13P50711 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa13P50711 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa13P50711 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa13P50711 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa13P50711 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa13P50711 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa13P50711 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa13P50711 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa13P50711 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa13P50711 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa13P50711 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa13P50711 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa13P50711 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa13P50711 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa13P50711 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms