Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cd7P50283 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cd7P50283 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cd7P50283 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Cd7P50283 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cd7P50283 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Cd7P50283 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Cd7P50283 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Cd7P50283 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Cd7P50283 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Cd7P50283 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Cd7P50283 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cd7P50283 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cd7P50283 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cd7P50283 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cd7P50283 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cd7P50283 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cd7P50283 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Cd7P50283 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
Cd7P50283 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Cd7P50283 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cd7P50283 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cd7P50283 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Cd7P50283 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cd7P50283 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Cd7P50283 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Cd7P50283 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Cd7P50283 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cd7P50283 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cd7P50283 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Cd7P50283 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Cd7P50283 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Cd7P50283 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Cd7P50283 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cd7P50283 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cd7P50283 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Cd7P50283 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Cd7P50283 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Cd7P50283 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Cd7P50283 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Cd7P50283 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Cd7P50283 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cd7P50283 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Cd7P50283 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
Cd7P50283 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Cd7P50283 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,69■■□□□ 1,22
Cd7P50283 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Cd7P50283 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Cd7P50283 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Cd7P50283 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Cd7P50283 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Cd7P50283 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Cd7P50283 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
Cd7P50283 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Cd7P50283 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Cd7P50283 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Cd7P50283 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd7P50283 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Cd7P50283 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
Cd7P50283 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Cd7P50283 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Cd7P50283 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Cd7P50283 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Cd7P50283 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Cd7P50283 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Cd7P50283 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Cd7P50283 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Cd7P50283 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Cd7P50283 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Cd7P50283 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Cd7P50283 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Cd7P50283 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Cd7P50283 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Cd7P50283 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Cd7P50283 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Cd7P50283 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Cd7P50283 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,15
Cd7P50283 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Cd7P50283 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Cd7P50283 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Cd7P50283 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,2 ms