Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
GastP48757 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
GastP48757 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
GastP48757 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,02■■□□□ 1,44
GastP48757 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
GastP48757 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
GastP48757 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
GastP48757 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
GastP48757 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,98■■□□□ 1,43
GastP48757 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
GastP48757 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
GastP48757 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
GastP48757 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
GastP48757 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
GastP48757 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
GastP48757 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
GastP48757 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
GastP48757 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,79■■□□□ 1,4
GastP48757 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
GastP48757 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
GastP48757 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
GastP48757 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
GastP48757 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
GastP48757 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
GastP48757 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,69■■□□□ 1,38
GastP48757 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
GastP48757 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
GastP48757 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
GastP48757 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,38
GastP48757 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
GastP48757 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
GastP48757 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
GastP48757 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
GastP48757 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
GastP48757 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
GastP48757 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,51■■□□□ 1,35
GastP48757 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
GastP48757 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
GastP48757 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
GastP48757 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
GastP48757 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
GastP48757 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
GastP48757 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
GastP48757 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
GastP48757 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
GastP48757 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
GastP48757 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,39■■□□□ 1,34
GastP48757 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
GastP48757 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
GastP48757 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
GastP48757 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
GastP48757 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
GastP48757 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
GastP48757 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,31■■□□□ 1,32
GastP48757 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
GastP48757 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
GastP48757 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
GastP48757 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
GastP48757 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,27■■□□□ 1,32
GastP48757 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
GastP48757 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
GastP48757 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
GastP48757 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
GastP48757 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
GastP48757 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
GastP48757 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
GastP48757 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
GastP48757 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
GastP48757 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
GastP48757 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
GastP48757 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
GastP48757 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
GastP48757 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
GastP48757 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
GastP48757 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
GastP48757 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,13■■□□□ 1,29
GastP48757 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
GastP48757 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
GastP48757 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
GastP48757 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
GastP48757 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
GastP48757 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
GastP48757 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
GastP48757 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
GastP48757 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
GastP48757 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
GastP48757 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
GastP48757 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
GastP48757 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
GastP48757 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
GastP48757 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
GastP48757 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
GastP48757 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
GastP48757 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,94■■□□□ 1,26
GastP48757 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
GastP48757 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
GastP48757 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,9■■□□□ 1,26
GastP48757 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
GastP48757 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
GastP48757 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms