Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl29P47915 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl29P47915 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl29P47915 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl29P47915 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl29P47915 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl29P47915 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl29P47915 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl29P47915 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl29P47915 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl29P47915 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl29P47915 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl29P47915 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl29P47915 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl29P47915 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl29P47915 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl29P47915 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl29P47915 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl29P47915 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl29P47915 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl29P47915 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl29P47915 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl29P47915 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl29P47915 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl29P47915 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl29P47915 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl29P47915 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl29P47915 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl29P47915 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl29P47915 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl29P47915 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl29P47915 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl29P47915 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl29P47915 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl29P47915 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl29P47915 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl29P47915 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl29P47915 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl29P47915 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl29P47915 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl29P47915 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl29P47915 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl29P47915 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl29P47915 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl29P47915 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl29P47915 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl29P47915 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl29P47915 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl29P47915 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl29P47915 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl29P47915 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl29P47915 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl29P47915 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl29P47915 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl29P47915 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl29P47915 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl29P47915 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl29P47915 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl29P47915 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl29P47915 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl29P47915 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl29P47915 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl29P47915 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms