Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ItgavP43406 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ItgavP43406 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ItgavP43406 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ItgavP43406 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ItgavP43406 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ItgavP43406 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ItgavP43406 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ItgavP43406 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItgavP43406 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ItgavP43406 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ItgavP43406 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ItgavP43406 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ItgavP43406 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ItgavP43406 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ItgavP43406 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ItgavP43406 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ItgavP43406 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ItgavP43406 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ItgavP43406 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ItgavP43406 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ItgavP43406 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ItgavP43406 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ItgavP43406 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ItgavP43406 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ItgavP43406 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ItgavP43406 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ItgavP43406 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ItgavP43406 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ItgavP43406 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ItgavP43406 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ItgavP43406 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgavP43406 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ItgavP43406 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ItgavP43406 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ItgavP43406 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ItgavP43406 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ItgavP43406 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ItgavP43406 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ItgavP43406 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ItgavP43406 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgavP43406 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgavP43406 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ItgavP43406 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ItgavP43406 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ItgavP43406 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ItgavP43406 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ItgavP43406 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ItgavP43406 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ItgavP43406 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ItgavP43406 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ItgavP43406 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ItgavP43406 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ItgavP43406 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ItgavP43406 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ItgavP43406 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgavP43406 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgavP43406 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgavP43406 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ItgavP43406 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ItgavP43406 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ItgavP43406 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ItgavP43406 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ItgavP43406 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ItgavP43406 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ItgavP43406 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ItgavP43406 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ItgavP43406 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ItgavP43406 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgavP43406 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgavP43406 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ItgavP43406 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ItgavP43406 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ItgavP43406 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ItgavP43406 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ItgavP43406 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ItgavP43406 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ItgavP43406 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ItgavP43406 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ItgavP43406 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ItgavP43406 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ItgavP43406 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ItgavP43406 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ItgavP43406 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ItgavP43406 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ItgavP43406 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ItgavP43406 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ItgavP43406 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ItgavP43406 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ItgavP43406 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ItgavP43406 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ItgavP43406 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ItgavP43406 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ItgavP43406 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms