Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmx3P42581 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx3P42581 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx3P42581 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx3P42581 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx3P42581 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx3P42581 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx3P42581 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx3P42581 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx3P42581 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx3P42581 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx3P42581 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx3P42581 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx3P42581 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx3P42581 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx3P42581 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx3P42581 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx3P42581 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx3P42581 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmx3P42581 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx3P42581 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx3P42581 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx3P42581 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx3P42581 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx3P42581 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx3P42581 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx3P42581 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmx3P42581 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmx3P42581 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmx3P42581 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmx3P42581 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmx3P42581 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmx3P42581 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmx3P42581 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx3P42581 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx3P42581 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmx3P42581 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmx3P42581 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx3P42581 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmx3P42581 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmx3P42581 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmx3P42581 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmx3P42581 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmx3P42581 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmx3P42581 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmx3P42581 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx3P42581 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx3P42581 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx3P42581 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx3P42581 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx3P42581 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx3P42581 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx3P42581 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx3P42581 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx3P42581 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx3P42581 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx3P42581 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx3P42581 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmx3P42581 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmx3P42581 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmx3P42581 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmx3P42581 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmx3P42581 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmx3P42581 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmx3P42581 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hmx3P42581 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmx3P42581 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmx3P42581 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmx3P42581 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hmx3P42581 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms