Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Ighmbp2P40694 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ighmbp2P40694 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ighmbp2P40694 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ighmbp2P40694 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ighmbp2P40694 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ighmbp2P40694 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ighmbp2P40694 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ighmbp2P40694 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ighmbp2P40694 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ighmbp2P40694 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ighmbp2P40694 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ighmbp2P40694 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ighmbp2P40694 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ighmbp2P40694 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Ighmbp2P40694 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ighmbp2P40694 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ighmbp2P40694 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ighmbp2P40694 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ighmbp2P40694 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ighmbp2P40694 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ighmbp2P40694 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ighmbp2P40694 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ighmbp2P40694 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Ighmbp2P40694 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ighmbp2P40694 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ighmbp2P40694 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ighmbp2P40694 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Ighmbp2P40694 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ighmbp2P40694 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Ighmbp2P40694 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ighmbp2P40694 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ighmbp2P40694 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ighmbp2P40694 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ighmbp2P40694 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ighmbp2P40694 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ighmbp2P40694 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ighmbp2P40694 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Ighmbp2P40694 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ighmbp2P40694 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ighmbp2P40694 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ighmbp2P40694 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ighmbp2P40694 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Ighmbp2P40694 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ighmbp2P40694 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ighmbp2P40694 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ighmbp2P40694 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ighmbp2P40694 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ighmbp2P40694 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ighmbp2P40694 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Ighmbp2P40694 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ighmbp2P40694 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ighmbp2P40694 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ighmbp2P40694 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Ighmbp2P40694 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Ighmbp2P40694 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ighmbp2P40694 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ighmbp2P40694 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ighmbp2P40694 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ighmbp2P40694 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ighmbp2P40694 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ighmbp2P40694 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ighmbp2P40694 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ighmbp2P40694 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ighmbp2P40694 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ighmbp2P40694 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Ighmbp2P40694 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ighmbp2P40694 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ighmbp2P40694 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ighmbp2P40694 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ighmbp2P40694 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ighmbp2P40694 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ighmbp2P40694 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ighmbp2P40694 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ighmbp2P40694 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Ighmbp2P40694 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ighmbp2P40694 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ighmbp2P40694 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ighmbp2P40694 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ighmbp2P40694 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ighmbp2P40694 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ighmbp2P40694 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ighmbp2P40694 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ighmbp2P40694 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ighmbp2P40694 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ighmbp2P40694 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ighmbp2P40694 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms