Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ighmbp2P40694 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ighmbp2P40694 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ighmbp2P40694 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ighmbp2P40694 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ighmbp2P40694 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ighmbp2P40694 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ighmbp2P40694 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ighmbp2P40694 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ighmbp2P40694 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ighmbp2P40694 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ighmbp2P40694 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ighmbp2P40694 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ighmbp2P40694 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ighmbp2P40694 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ighmbp2P40694 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ighmbp2P40694 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ighmbp2P40694 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ighmbp2P40694 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ighmbp2P40694 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ighmbp2P40694 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ighmbp2P40694 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ighmbp2P40694 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ighmbp2P40694 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ighmbp2P40694 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ighmbp2P40694 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ighmbp2P40694 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ighmbp2P40694 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ighmbp2P40694 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ighmbp2P40694 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ighmbp2P40694 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ighmbp2P40694 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ighmbp2P40694 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ighmbp2P40694 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ighmbp2P40694 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ighmbp2P40694 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ighmbp2P40694 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ighmbp2P40694 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ighmbp2P40694 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ighmbp2P40694 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ighmbp2P40694 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ighmbp2P40694 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ighmbp2P40694 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ighmbp2P40694 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ighmbp2P40694 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ighmbp2P40694 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ighmbp2P40694 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ighmbp2P40694 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ighmbp2P40694 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ighmbp2P40694 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ighmbp2P40694 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ighmbp2P40694 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ighmbp2P40694 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ighmbp2P40694 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ighmbp2P40694 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ighmbp2P40694 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ighmbp2P40694 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ighmbp2P40694 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ighmbp2P40694 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ighmbp2P40694 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ighmbp2P40694 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ighmbp2P40694 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ighmbp2P40694 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ighmbp2P40694 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ighmbp2P40694 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ighmbp2P40694 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ighmbp2P40694 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ighmbp2P40694 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ighmbp2P40694 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ighmbp2P40694 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ighmbp2P40694 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ighmbp2P40694 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ighmbp2P40694 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ighmbp2P40694 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ighmbp2P40694 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ighmbp2P40694 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ighmbp2P40694 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ighmbp2P40694 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ighmbp2P40694 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ighmbp2P40694 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ighmbp2P40694 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ighmbp2P40694 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ighmbp2P40694 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ighmbp2P40694 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ighmbp2P40694 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ighmbp2P40694 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ighmbp2P40694 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms