Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox6P40645 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox6P40645 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox6P40645 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox6P40645 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox6P40645 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox6P40645 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox6P40645 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox6P40645 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox6P40645 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox6P40645 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox6P40645 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox6P40645 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox6P40645 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox6P40645 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox6P40645 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox6P40645 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox6P40645 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox6P40645 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox6P40645 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sox6P40645 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox6P40645 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox6P40645 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox6P40645 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox6P40645 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox6P40645 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox6P40645 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox6P40645 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox6P40645 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox6P40645 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox6P40645 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox6P40645 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox6P40645 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox6P40645 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox6P40645 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox6P40645 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox6P40645 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox6P40645 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox6P40645 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sox6P40645 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox6P40645 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox6P40645 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox6P40645 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox6P40645 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox6P40645 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox6P40645 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox6P40645 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox6P40645 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox6P40645 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox6P40645 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox6P40645 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox6P40645 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox6P40645 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox6P40645 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox6P40645 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox6P40645 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox6P40645 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox6P40645 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox6P40645 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox6P40645 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox6P40645 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox6P40645 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox6P40645 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox6P40645 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms