Protein–RNA interactions for Protein: P35917

Flt4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt4P35917 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Flt4P35917 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Flt4P35917 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Flt4P35917 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Flt4P35917 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Flt4P35917 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Flt4P35917 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Flt4P35917 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Flt4P35917 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Flt4P35917 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Flt4P35917 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Flt4P35917 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Flt4P35917 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Flt4P35917 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Flt4P35917 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Flt4P35917 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Flt4P35917 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Flt4P35917 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Flt4P35917 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Flt4P35917 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Flt4P35917 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Flt4P35917 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Flt4P35917 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Flt4P35917 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Flt4P35917 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Flt4P35917 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Flt4P35917 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Flt4P35917 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Flt4P35917 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Flt4P35917 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Flt4P35917 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Flt4P35917 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Flt4P35917 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Flt4P35917 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Flt4P35917 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Flt4P35917 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Flt4P35917 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Flt4P35917 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Flt4P35917 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Flt4P35917 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Flt4P35917 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Flt4P35917 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Flt4P35917 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Flt4P35917 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Flt4P35917 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Flt4P35917 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Flt4P35917 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Flt4P35917 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Flt4P35917 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Flt4P35917 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Flt4P35917 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Flt4P35917 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Flt4P35917 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Flt4P35917 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Flt4P35917 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Flt4P35917 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Flt4P35917 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Flt4P35917 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Flt4P35917 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Flt4P35917 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Flt4P35917 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Flt4P35917 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Flt4P35917 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Flt4P35917 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Flt4P35917 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Flt4P35917 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Flt4P35917 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Flt4P35917 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Flt4P35917 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Flt4P35917 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Flt4P35917 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Flt4P35917 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Flt4P35917 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Flt4P35917 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Flt4P35917 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Flt4P35917 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Flt4P35917 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Flt4P35917 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Flt4P35917 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Flt4P35917 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Flt4P35917 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Flt4P35917 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Flt4P35917 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Flt4P35917 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Flt4P35917 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Flt4P35917 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Flt4P35917 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Flt4P35917 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms