Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rab20P35295 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rab20P35295 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rab20P35295 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rab20P35295 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rab20P35295 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rab20P35295 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rab20P35295 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Rab20P35295 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Rab20P35295 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rab20P35295 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rab20P35295 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Rab20P35295 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rab20P35295 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Rab20P35295 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Rab20P35295 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Rab20P35295 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Rab20P35295 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rab20P35295 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Rab20P35295 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Rab20P35295 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rab20P35295 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Rab20P35295 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rab20P35295 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Rab20P35295 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Rab20P35295 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rab20P35295 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab20P35295 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab20P35295 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rab20P35295 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rab20P35295 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rab20P35295 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rab20P35295 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rab20P35295 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rab20P35295 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Rab20P35295 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rab20P35295 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rab20P35295 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rab20P35295 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Rab20P35295 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Rab20P35295 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rab20P35295 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rab20P35295 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rab20P35295 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rab20P35295 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rab20P35295 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rab20P35295 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rab20P35295 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rab20P35295 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rab20P35295 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rab20P35295 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rab20P35295 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Rab20P35295 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Rab20P35295 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,53■■■□□ 2
Rab20P35295 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rab20P35295 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rab20P35295 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Rab20P35295 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rab20P35295 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rab20P35295 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rab20P35295 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rab20P35295 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rab20P35295 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rab20P35295 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Rab20P35295 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Rab20P35295 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rab20P35295 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rab20P35295 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Rab20P35295 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Rab20P35295 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rab20P35295 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rab20P35295 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rab20P35295 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rab20P35295 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Rab20P35295 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rab20P35295 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rab20P35295 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Rab20P35295 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rab20P35295 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rab20P35295 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rab20P35295 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rab20P35295 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Rab20P35295 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rab20P35295 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rab20P35295 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rab20P35295 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rab20P35295 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rab20P35295 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rab20P35295 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rab20P35295 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Rab20P35295 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rab20P35295 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rab20P35295 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,1 ms