Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoc1P34928 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoc1P34928 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoc1P34928 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoc1P34928 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoc1P34928 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoc1P34928 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apoc1P34928 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apoc1P34928 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoc1P34928 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoc1P34928 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoc1P34928 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoc1P34928 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apoc1P34928 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoc1P34928 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoc1P34928 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoc1P34928 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoc1P34928 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoc1P34928 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoc1P34928 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoc1P34928 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoc1P34928 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoc1P34928 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoc1P34928 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoc1P34928 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoc1P34928 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoc1P34928 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoc1P34928 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoc1P34928 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoc1P34928 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoc1P34928 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoc1P34928 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoc1P34928 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoc1P34928 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoc1P34928 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoc1P34928 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoc1P34928 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoc1P34928 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoc1P34928 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoc1P34928 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoc1P34928 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoc1P34928 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apoc1P34928 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoc1P34928 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoc1P34928 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoc1P34928 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc1P34928 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoc1P34928 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoc1P34928 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoc1P34928 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoc1P34928 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoc1P34928 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoc1P34928 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoc1P34928 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoc1P34928 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoc1P34928 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoc1P34928 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoc1P34928 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoc1P34928 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoc1P34928 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoc1P34928 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoc1P34928 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoc1P34928 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoc1P34928 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoc1P34928 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc1P34928 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc1P34928 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc1P34928 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoc1P34928 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms