Protein–RNA interactions for Protein: P32507

Nectin2, Nectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin2P32507 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Nectin2P32507 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Nectin2P32507 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Nectin2P32507 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Nectin2P32507 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Nectin2P32507 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Nectin2P32507 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Nectin2P32507 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Nectin2P32507 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Nectin2P32507 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Nectin2P32507 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Nectin2P32507 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Nectin2P32507 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Nectin2P32507 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Nectin2P32507 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Nectin2P32507 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,22
Nectin2P32507 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Nectin2P32507 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Nectin2P32507 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Nectin2P32507 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Nectin2P32507 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Nectin2P32507 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Nectin2P32507 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nectin2P32507 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nectin2P32507 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Nectin2P32507 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Nectin2P32507 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Nectin2P32507 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Nectin2P32507 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Nectin2P32507 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Nectin2P32507 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Nectin2P32507 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Nectin2P32507 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Nectin2P32507 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Nectin2P32507 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Nectin2P32507 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Nectin2P32507 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Nectin2P32507 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Nectin2P32507 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
Nectin2P32507 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Nectin2P32507 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Nectin2P32507 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Nectin2P32507 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Nectin2P32507 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Nectin2P32507 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Nectin2P32507 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Nectin2P32507 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Nectin2P32507 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Nectin2P32507 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Nectin2P32507 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Nectin2P32507 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Nectin2P32507 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Nectin2P32507 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Nectin2P32507 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Nectin2P32507 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Nectin2P32507 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nectin2P32507 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nectin2P32507 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Nectin2P32507 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Nectin2P32507 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nectin2P32507 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nectin2P32507 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nectin2P32507 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nectin2P32507 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nectin2P32507 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Nectin2P32507 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Nectin2P32507 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Nectin2P32507 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nectin2P32507 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Nectin2P32507 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Nectin2P32507 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,81■■■■□ 3
Nectin2P32507 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Nectin2P32507 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Nectin2P32507 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Nectin2P32507 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Nectin2P32507 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Nectin2P32507 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Nectin2P32507 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Nectin2P32507 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Nectin2P32507 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Nectin2P32507 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Nectin2P32507 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Nectin2P32507 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Nectin2P32507 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Nectin2P32507 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Nectin2P32507 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Nectin2P32507 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Nectin2P32507 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms