Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc11P31313 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc11P31313 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc11P31313 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc11P31313 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc11P31313 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc11P31313 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc11P31313 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc11P31313 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc11P31313 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc11P31313 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc11P31313 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc11P31313 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc11P31313 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc11P31313 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc11P31313 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc11P31313 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc11P31313 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc11P31313 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc11P31313 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc11P31313 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc11P31313 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc11P31313 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc11P31313 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc11P31313 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc11P31313 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc11P31313 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc11P31313 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc11P31313 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc11P31313 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxc11P31313 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxc11P31313 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxc11P31313 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxc11P31313 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxc11P31313 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxc11P31313 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc11P31313 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc11P31313 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc11P31313 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc11P31313 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc11P31313 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc11P31313 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxc11P31313 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc11P31313 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc11P31313 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc11P31313 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc11P31313 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc11P31313 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc11P31313 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc11P31313 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxc11P31313 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxc11P31313 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc11P31313 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc11P31313 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc11P31313 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc11P31313 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc11P31313 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc11P31313 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc11P31313 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc11P31313 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc11P31313 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc11P31313 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc11P31313 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc11P31313 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc11P31313 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc11P31313 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc11P31313 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc11P31313 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc11P31313 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc11P31313 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc11P31313 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc11P31313 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc11P31313 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc11P31313 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc11P31313 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc11P31313 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc11P31313 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxc11P31313 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc11P31313 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc11P31313 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc11P31313 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc11P31313 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc11P31313 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc11P31313 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc11P31313 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc11P31313 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc11P31313 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc11P31313 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc11P31313 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxc11P31313 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc11P31313 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc11P31313 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc11P31313 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc11P31313 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc11P31313 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc11P31313 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxc11P31313 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxc11P31313 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc11P31313 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc11P31313 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms