Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa10P31310 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa10P31310 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa10P31310 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa10P31310 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa10P31310 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa10P31310 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa10P31310 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa10P31310 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa10P31310 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa10P31310 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa10P31310 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa10P31310 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa10P31310 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa10P31310 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa10P31310 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa10P31310 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa10P31310 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa10P31310 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa10P31310 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa10P31310 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa10P31310 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa10P31310 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa10P31310 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa10P31310 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa10P31310 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa10P31310 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa10P31310 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa10P31310 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa10P31310 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa10P31310 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa10P31310 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa10P31310 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa10P31310 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa10P31310 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa10P31310 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa10P31310 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa10P31310 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa10P31310 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa10P31310 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa10P31310 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa10P31310 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa10P31310 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa10P31310 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa10P31310 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa10P31310 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa10P31310 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa10P31310 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa10P31310 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa10P31310 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa10P31310 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa10P31310 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa10P31310 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa10P31310 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa10P31310 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa10P31310 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa10P31310 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa10P31310 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa10P31310 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa10P31310 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa10P31310 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa10P31310 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxa10P31310 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa10P31310 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa10P31310 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa10P31310 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa10P31310 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa10P31310 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa10P31310 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa10P31310 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa10P31310 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa10P31310 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa10P31310 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa10P31310 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa10P31310 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa10P31310 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa10P31310 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa10P31310 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa10P31310 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa10P31310 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa10P31310 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa10P31310 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa10P31310 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa10P31310 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms