Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DcnP28654 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DcnP28654 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DcnP28654 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DcnP28654 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DcnP28654 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DcnP28654 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcnP28654 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DcnP28654 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcnP28654 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DcnP28654 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DcnP28654 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DcnP28654 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DcnP28654 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DcnP28654 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DcnP28654 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcnP28654 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DcnP28654 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DcnP28654 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DcnP28654 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DcnP28654 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DcnP28654 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DcnP28654 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DcnP28654 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DcnP28654 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DcnP28654 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DcnP28654 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DcnP28654 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcnP28654 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DcnP28654 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DcnP28654 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DcnP28654 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DcnP28654 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DcnP28654 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DcnP28654 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcnP28654 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DcnP28654 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DcnP28654 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DcnP28654 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DcnP28654 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DcnP28654 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DcnP28654 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DcnP28654 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DcnP28654 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DcnP28654 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DcnP28654 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DcnP28654 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DcnP28654 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DcnP28654 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DcnP28654 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DcnP28654 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DcnP28654 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DcnP28654 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DcnP28654 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DcnP28654 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DcnP28654 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DcnP28654 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DcnP28654 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DcnP28654 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DcnP28654 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DcnP28654 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DcnP28654 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DcnP28654 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DcnP28654 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DcnP28654 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DcnP28654 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DcnP28654 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DcnP28654 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DcnP28654 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DcnP28654 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DcnP28654 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DcnP28654 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DcnP28654 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DcnP28654 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DcnP28654 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DcnP28654 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DcnP28654 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DcnP28654 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DcnP28654 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DcnP28654 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DcnP28654 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DcnP28654 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DcnP28654 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcnP28654 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcnP28654 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DcnP28654 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DcnP28654 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcnP28654 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcnP28654 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DcnP28654 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DcnP28654 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcnP28654 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcnP28654 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DcnP28654 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcnP28654 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DcnP28654 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcnP28654 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcnP28654 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcnP28654 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcnP28654 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms