Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LynP25911 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LynP25911 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LynP25911 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LynP25911 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LynP25911 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LynP25911 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LynP25911 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LynP25911 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LynP25911 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LynP25911 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LynP25911 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LynP25911 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LynP25911 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LynP25911 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LynP25911 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LynP25911 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LynP25911 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LynP25911 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LynP25911 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LynP25911 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LynP25911 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LynP25911 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LynP25911 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LynP25911 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LynP25911 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LynP25911 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LynP25911 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LynP25911 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LynP25911 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LynP25911 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LynP25911 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LynP25911 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LynP25911 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LynP25911 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LynP25911 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LynP25911 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LynP25911 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LynP25911 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LynP25911 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LynP25911 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LynP25911 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LynP25911 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LynP25911 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LynP25911 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LynP25911 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LynP25911 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LynP25911 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LynP25911 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LynP25911 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LynP25911 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LynP25911 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LynP25911 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LynP25911 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LynP25911 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LynP25911 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LynP25911 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LynP25911 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LynP25911 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LynP25911 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LynP25911 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LynP25911 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LynP25911 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LynP25911 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LynP25911 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LynP25911 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LynP25911 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LynP25911 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LynP25911 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LynP25911 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LynP25911 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LynP25911 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LynP25911 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LynP25911 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LynP25911 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LynP25911 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LynP25911 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LynP25911 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LynP25911 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LynP25911 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LynP25911 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LynP25911 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LynP25911 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LynP25911 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LynP25911 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LynP25911 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LynP25911 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LynP25911 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LynP25911 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LynP25911 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LynP25911 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LynP25911 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LynP25911 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LynP25911 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LynP25911 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LynP25911 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LynP25911 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LynP25911 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LynP25911 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LynP25911 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms