Protein–RNA interactions for Protein: P24860

Ccnb1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1P24860 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccnb1P24860 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccnb1P24860 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccnb1P24860 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccnb1P24860 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnb1P24860 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccnb1P24860 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccnb1P24860 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccnb1P24860 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccnb1P24860 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnb1P24860 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccnb1P24860 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnb1P24860 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccnb1P24860 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccnb1P24860 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccnb1P24860 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccnb1P24860 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccnb1P24860 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccnb1P24860 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnb1P24860 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnb1P24860 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccnb1P24860 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccnb1P24860 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnb1P24860 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccnb1P24860 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnb1P24860 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccnb1P24860 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnb1P24860 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnb1P24860 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccnb1P24860 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccnb1P24860 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccnb1P24860 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccnb1P24860 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccnb1P24860 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccnb1P24860 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccnb1P24860 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccnb1P24860 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccnb1P24860 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccnb1P24860 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccnb1P24860 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccnb1P24860 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccnb1P24860 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccnb1P24860 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccnb1P24860 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccnb1P24860 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccnb1P24860 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccnb1P24860 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccnb1P24860 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccnb1P24860 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccnb1P24860 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccnb1P24860 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccnb1P24860 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnb1P24860 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnb1P24860 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnb1P24860 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccnb1P24860 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccnb1P24860 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccnb1P24860 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccnb1P24860 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccnb1P24860 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccnb1P24860 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnb1P24860 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnb1P24860 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccnb1P24860 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccnb1P24860 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccnb1P24860 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccnb1P24860 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccnb1P24860 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccnb1P24860 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccnb1P24860 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccnb1P24860 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccnb1P24860 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccnb1P24860 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccnb1P24860 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccnb1P24860 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccnb1P24860 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccnb1P24860 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnb1P24860 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccnb1P24860 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnb1P24860 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccnb1P24860 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnb1P24860 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccnb1P24860 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccnb1P24860 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccnb1P24860 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnb1P24860 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnb1P24860 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms