Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Rpl13aP19253 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Rpl13aP19253 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Rpl13aP19253 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,63■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,58■□□□□ 0,73
Rpl13aP19253 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,53■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Rpl13aP19253 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,51■□□□□ 0,71
Rpl13aP19253 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Rpl13aP19253 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19,48■□□□□ 0,71
Rpl13aP19253 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Rpl13aP19253 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Rpl13aP19253 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Rpl13aP19253 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Rpl13aP19253 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Rpl13aP19253 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Rpl13aP19253 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Rpl13aP19253 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Rpl13aP19253 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Rpl13aP19253 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19,36■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Rpl13aP19253 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,33■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,32■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Rpl13aP19253 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,25■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Rpl13aP19253 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Rpl13aP19253 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Rpl13aP19253 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Rpl13aP19253 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,2■□□□□ 0,66
Rpl13aP19253 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Rpl13aP19253 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Rpl13aP19253 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Rpl13aP19253 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,05■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Rpl13aP19253 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Rpl13aP19253 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Rpl13aP19253 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Rpl13aP19253 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Rpl13aP19253 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Rpl13aP19253 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Rpl13aP19253 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Rpl13aP19253 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Rpl13aP19253 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Rpl13aP19253 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Rpl13aP19253 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Rpl13aP19253 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18,84■□□□□ 0,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,4 ms