Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnnc1P19123 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnnc1P19123 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnnc1P19123 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnnc1P19123 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnc1P19123 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnnc1P19123 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnc1P19123 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnnc1P19123 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnnc1P19123 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnnc1P19123 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnc1P19123 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnc1P19123 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnc1P19123 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnc1P19123 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnc1P19123 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnc1P19123 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnnc1P19123 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnc1P19123 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnc1P19123 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnc1P19123 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnc1P19123 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnc1P19123 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnc1P19123 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnc1P19123 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnc1P19123 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnc1P19123 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnc1P19123 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnc1P19123 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnc1P19123 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnc1P19123 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnc1P19123 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnc1P19123 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnc1P19123 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tnnc1P19123 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnc1P19123 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnc1P19123 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnnc1P19123 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tnnc1P19123 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnc1P19123 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnc1P19123 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnc1P19123 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnc1P19123 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnc1P19123 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnc1P19123 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnc1P19123 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnc1P19123 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnc1P19123 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnc1P19123 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnc1P19123 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnc1P19123 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnc1P19123 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnc1P19123 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnc1P19123 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnc1P19123 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnc1P19123 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnc1P19123 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnc1P19123 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnc1P19123 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnnc1P19123 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnc1P19123 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnc1P19123 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnc1P19123 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnc1P19123 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnnc1P19123 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnnc1P19123 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnc1P19123 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnc1P19123 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tnnc1P19123 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnc1P19123 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnnc1P19123 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnc1P19123 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnc1P19123 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnc1P19123 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnc1P19123 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnc1P19123 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnc1P19123 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnc1P19123 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnc1P19123 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms