Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra6P16305 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra6P16305 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra6P16305 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra6P16305 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra6P16305 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra6P16305 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra6P16305 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra6P16305 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabra6P16305 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra6P16305 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra6P16305 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra6P16305 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra6P16305 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabra6P16305 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabra6P16305 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabra6P16305 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabra6P16305 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabra6P16305 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabra6P16305 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra6P16305 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabra6P16305 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabra6P16305 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabra6P16305 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabra6P16305 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabra6P16305 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabra6P16305 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabra6P16305 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabra6P16305 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra6P16305 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra6P16305 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra6P16305 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra6P16305 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra6P16305 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra6P16305 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabra6P16305 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabra6P16305 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabra6P16305 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabra6P16305 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabra6P16305 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra6P16305 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra6P16305 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabra6P16305 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra6P16305 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra6P16305 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra6P16305 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra6P16305 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra6P16305 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra6P16305 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra6P16305 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra6P16305 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra6P16305 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra6P16305 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra6P16305 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra6P16305 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra6P16305 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra6P16305 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra6P16305 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms