Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ChgbP16014 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ChgbP16014 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ChgbP16014 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ChgbP16014 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ChgbP16014 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ChgbP16014 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ChgbP16014 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChgbP16014 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgbP16014 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgbP16014 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChgbP16014 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgbP16014 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ChgbP16014 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChgbP16014 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChgbP16014 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ChgbP16014 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChgbP16014 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChgbP16014 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ChgbP16014 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgbP16014 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChgbP16014 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChgbP16014 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChgbP16014 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChgbP16014 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgbP16014 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgbP16014 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgbP16014 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgbP16014 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChgbP16014 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChgbP16014 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ChgbP16014 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgbP16014 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ChgbP16014 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChgbP16014 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChgbP16014 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ChgbP16014 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChgbP16014 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgbP16014 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChgbP16014 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChgbP16014 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChgbP16014 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChgbP16014 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChgbP16014 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgbP16014 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgbP16014 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ChgbP16014 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgbP16014 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgbP16014 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgbP16014 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgbP16014 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgbP16014 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChgbP16014 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgbP16014 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgbP16014 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgbP16014 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChgbP16014 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ChgbP16014 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChgbP16014 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChgbP16014 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChgbP16014 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChgbP16014 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChgbP16014 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChgbP16014 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgbP16014 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgbP16014 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ChgbP16014 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChgbP16014 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChgbP16014 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChgbP16014 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgbP16014 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgbP16014 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgbP16014 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgbP16014 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgbP16014 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChgbP16014 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChgbP16014 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgbP16014 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgbP16014 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChgbP16014 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ChgbP16014 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChgbP16014 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ChgbP16014 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ChgbP16014 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChgbP16014 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChgbP16014 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms