Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tnni2P13412 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Tnni2P13412 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnni2P13412 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tnni2P13412 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tnni2P13412 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tnni2P13412 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tnni2P13412 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tnni2P13412 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tnni2P13412 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tnni2P13412 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnni2P13412 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tnni2P13412 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tnni2P13412 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnni2P13412 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tnni2P13412 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tnni2P13412 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tnni2P13412 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tnni2P13412 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tnni2P13412 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tnni2P13412 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tnni2P13412 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Tnni2P13412 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tnni2P13412 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tnni2P13412 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Tnni2P13412 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tnni2P13412 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tnni2P13412 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Tnni2P13412 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Tnni2P13412 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Tnni2P13412 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tnni2P13412 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tnni2P13412 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tnni2P13412 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tnni2P13412 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tnni2P13412 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tnni2P13412 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tnni2P13412 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tnni2P13412 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tnni2P13412 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tnni2P13412 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tnni2P13412 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tnni2P13412 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tnni2P13412 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tnni2P13412 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tnni2P13412 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Tnni2P13412 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tnni2P13412 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tnni2P13412 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Tnni2P13412 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tnni2P13412 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Tnni2P13412 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tnni2P13412 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tnni2P13412 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tnni2P13412 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tnni2P13412 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tnni2P13412 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tnni2P13412 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tnni2P13412 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tnni2P13412 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tnni2P13412 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Tnni2P13412 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tnni2P13412 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tnni2P13412 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tnni2P13412 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Tnni2P13412 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Tnni2P13412 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tnni2P13412 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tnni2P13412 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tnni2P13412 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tnni2P13412 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tnni2P13412 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tnni2P13412 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tnni2P13412 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tnni2P13412 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tnni2P13412 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tnni2P13412 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tnni2P13412 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tnni2P13412 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tnni2P13412 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tnni2P13412 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tnni2P13412 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tnni2P13412 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tnni2P13412 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tnni2P13412 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tnni2P13412 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tnni2P13412 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Tnni2P13412 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tnni2P13412 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tnni2P13412 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Tnni2P13412 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Tnni2P13412 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tnni2P13412 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tnni2P13412 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms