Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P10404 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P10404 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P10404 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P10404 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P10404 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P10404 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P10404 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P10404 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P10404 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P10404 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P10404 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P10404 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P10404 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P10404 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P10404 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P10404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P10404 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P10404 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P10404 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P10404 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P10404 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P10404 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P10404 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P10404 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P10404 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P10404 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P10404 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P10404 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P10404 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P10404 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P10404 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P10404 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P10404 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P10404 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P10404 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P10404 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P10404 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P10404 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P10404 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P10404 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P10404 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P10404 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P10404 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P10404 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P10404 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P10404 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P10404 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P10404 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P10404 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P10404 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P10404 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P10404 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P10404 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P10404 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P10404 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P10404 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P10404 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P10404 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P10404 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P10404 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P10404 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P10404 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P10404 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P10404 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P10404 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P10404 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P10404 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P10404 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P10404 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P10404 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
P10404 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P10404 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P10404 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P10404 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P10404 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P10404 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P10404 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P10404 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P10404 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P10404 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P10404 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P10404 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P10404 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P10404 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P10404 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P10404 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P10404 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P10404 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P10404 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P10404 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P10404 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P10404 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P10404 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P10404 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P10404 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P10404 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P10404 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P10404 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P10404 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms