Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa5P09021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa5P09021 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa5P09021 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa5P09021 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa5P09021 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa5P09021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa5P09021 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa5P09021 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa5P09021 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa5P09021 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa5P09021 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa5P09021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa5P09021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa5P09021 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa5P09021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa5P09021 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa5P09021 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa5P09021 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa5P09021 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa5P09021 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa5P09021 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa5P09021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa5P09021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa5P09021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa5P09021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa5P09021 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa5P09021 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa5P09021 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa5P09021 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa5P09021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa5P09021 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa5P09021 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa5P09021 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa5P09021 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa5P09021 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa5P09021 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa5P09021 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa5P09021 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxa5P09021 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa5P09021 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa5P09021 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa5P09021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa5P09021 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa5P09021 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms