Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Hoxa5P09021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Hoxa5P09021 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Hoxa5P09021 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Hoxa5P09021 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Hoxa5P09021 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Hoxa5P09021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,3■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Hoxa5P09021 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Hoxa5P09021 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Hoxa5P09021 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Hoxa5P09021 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Hoxa5P09021 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Hoxa5P09021 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Hoxa5P09021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Hoxa5P09021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Hoxa5P09021 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Hoxa5P09021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Hoxa5P09021 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Hoxa5P09021 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Hoxa5P09021 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Hoxa5P09021 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Hoxa5P09021 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Hoxa5P09021 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Hoxa5P09021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Hoxa5P09021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Hoxa5P09021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Hoxa5P09021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Hoxa5P09021 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Hoxa5P09021 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Hoxa5P09021 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Hoxa5P09021 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Hoxa5P09021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Hoxa5P09021 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Hoxa5P09021 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Hoxa5P09021 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Hoxa5P09021 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Hoxa5P09021 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Hoxa5P09021 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,59■□□□□ 0,89
Hoxa5P09021 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Hoxa5P09021 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,52■□□□□ 0,87
Hoxa5P09021 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Hoxa5P09021 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Hoxa5P09021 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Hoxa5P09021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Hoxa5P09021 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Hoxa5P09021 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Hoxa5P09021 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Hoxa5P09021 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Hoxa5P09021 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Hoxa5P09021 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Hoxa5P09021 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,1 ms