Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
SparcP07214 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
SparcP07214 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
SparcP07214 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
SparcP07214 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
SparcP07214 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
SparcP07214 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
SparcP07214 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
SparcP07214 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
SparcP07214 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
SparcP07214 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
SparcP07214 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
SparcP07214 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
SparcP07214 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
SparcP07214 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
SparcP07214 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
SparcP07214 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
SparcP07214 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
SparcP07214 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
SparcP07214 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
SparcP07214 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
SparcP07214 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,86■■□□□ 1,41
SparcP07214 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
SparcP07214 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
SparcP07214 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
SparcP07214 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
SparcP07214 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
SparcP07214 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
SparcP07214 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
SparcP07214 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
SparcP07214 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
SparcP07214 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
SparcP07214 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
SparcP07214 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
SparcP07214 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
SparcP07214 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
SparcP07214 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
SparcP07214 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
SparcP07214 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
SparcP07214 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
SparcP07214 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
SparcP07214 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
SparcP07214 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
SparcP07214 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,59■■□□□ 1,37
SparcP07214 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
SparcP07214 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
SparcP07214 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
SparcP07214 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
SparcP07214 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
SparcP07214 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
SparcP07214 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,5■■□□□ 1,35
SparcP07214 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
SparcP07214 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
SparcP07214 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
SparcP07214 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
SparcP07214 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
SparcP07214 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
SparcP07214 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
SparcP07214 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
SparcP07214 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
SparcP07214 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
SparcP07214 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
SparcP07214 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
SparcP07214 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
SparcP07214 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
SparcP07214 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
SparcP07214 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
SparcP07214 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
SparcP07214 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
SparcP07214 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
SparcP07214 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
SparcP07214 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
SparcP07214 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
SparcP07214 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
SparcP07214 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
SparcP07214 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
SparcP07214 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
SparcP07214 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
SparcP07214 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
SparcP07214 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
SparcP07214 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
SparcP07214 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
SparcP07214 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,12■■□□□ 1,29
SparcP07214 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
SparcP07214 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
SparcP07214 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
SparcP07214 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
SparcP07214 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
SparcP07214 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
SparcP07214 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
SparcP07214 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
SparcP07214 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
SparcP07214 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
SparcP07214 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
SparcP07214 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
SparcP07214 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
SparcP07214 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
SparcP07214 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
SparcP07214 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
SparcP07214 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
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