Protein–RNA interactions for Protein: P04946

Ig kappa chain V-V region NQ5-89.4, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04946 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P04946 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
P04946 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P04946 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04946 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P04946 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04946 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04946 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P04946 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P04946 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P04946 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P04946 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P04946 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
P04946 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P04946 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P04946 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P04946 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04946 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04946 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
P04946 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04946 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04946 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04946 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
P04946 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
P04946 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04946 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04946 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P04946 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04946 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04946 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P04946 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04946 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P04946 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P04946 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P04946 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P04946 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P04946 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P04946 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P04946 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P04946 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P04946 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P04946 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P04946 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
P04946 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P04946 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
P04946 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P04946 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P04946 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P04946 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04946 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
P04946 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04946 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04946 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04946 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P04946 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P04946 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04946 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04946 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04946 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04946 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P04946 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04946 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04946 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04946 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04946 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04946 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04946 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04946 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04946 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P04946 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P04946 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P04946 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04946 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04946 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P04946 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04946 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04946 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04946 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04946 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04946 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04946 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P04946 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P04946 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P04946 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04946 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04946 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04946 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04946 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04946 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04946 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04946 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04946 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04946 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04946 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04946 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04946 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04946 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P04946 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P04946 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P04946 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms