Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
P04224 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
P04224 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
P04224 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
P04224 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
P04224 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
P04224 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
P04224 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
P04224 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
P04224 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
P04224 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
P04224 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
P04224 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P04224 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
P04224 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
P04224 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
P04224 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
P04224 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
P04224 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
P04224 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
P04224 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
P04224 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
P04224 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
P04224 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
P04224 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
P04224 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,12■■□□□ 1,29
P04224 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
P04224 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
P04224 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
P04224 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
P04224 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
P04224 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
P04224 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
P04224 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,03■■□□□ 1,28
P04224 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
P04224 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
P04224 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
P04224 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
P04224 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
P04224 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
P04224 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
P04224 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
P04224 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
P04224 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
P04224 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
P04224 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
P04224 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
P04224 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
P04224 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
P04224 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
P04224 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
P04224 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
P04224 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
P04224 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,81■■□□□ 1,24
P04224 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
P04224 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
P04224 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
P04224 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
P04224 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
P04224 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
P04224 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
P04224 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
P04224 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
P04224 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
P04224 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
P04224 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
P04224 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
P04224 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
P04224 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
P04224 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P04224 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
P04224 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
P04224 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
P04224 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
P04224 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
P04224 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
P04224 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
P04224 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
P04224 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
P04224 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
P04224 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
P04224 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
P04224 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
P04224 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
P04224 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,47■■□□□ 1,19
P04224 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
P04224 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
P04224 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
P04224 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
P04224 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
P04224 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
P04224 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
P04224 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
P04224 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
P04224 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
P04224 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
P04224 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
P04224 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
P04224 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
P04224 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms