Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01851 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01851 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P01851 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P01851 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P01851 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01851 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01851 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
P01851 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01851 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01851 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P01851 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01851 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01851 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01851 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01851 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P01851 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P01851 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01851 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
P01851 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01851 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01851 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P01851 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
P01851 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P01851 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P01851 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P01851 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P01851 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P01851 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
P01851 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P01851 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P01851 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P01851 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P01851 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P01851 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P01851 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P01851 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P01851 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P01851 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01851 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P01851 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P01851 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P01851 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P01851 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P01851 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P01851 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P01851 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
P01851 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
P01851 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
P01851 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
P01851 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01851 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P01851 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01851 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
P01851 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01851 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01851 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01851 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01851 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01851 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P01851 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01851 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P01851 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01851 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01851 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01851 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01851 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01851 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01851 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01851 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P01851 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01851 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01851 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01851 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01851 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01851 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01851 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01851 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01851 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P01851 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
P01851 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01851 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01851 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01851 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01851 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01851 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01851 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01851 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01851 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01851 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01851 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01851 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01851 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01851 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01851 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01851 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01851 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01851 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01851 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01851 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms