Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
P01807 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
P01807 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
P01807 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
P01807 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
P01807 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01807 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P01807 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
P01807 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
P01807 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
P01807 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
P01807 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
P01807 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
P01807 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
P01807 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P01807 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
P01807 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
P01807 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
P01807 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P01807 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
P01807 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P01807 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P01807 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01807 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P01807 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P01807 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P01807 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P01807 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P01807 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P01807 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
P01807 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01807 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
P01807 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01807 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01807 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
P01807 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
P01807 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01807 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
P01807 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01807 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
P01807 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
P01807 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P01807 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P01807 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
P01807 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
P01807 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
P01807 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
P01807 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
P01807 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
P01807 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
P01807 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
P01807 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
P01807 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
P01807 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
P01807 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
P01807 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
P01807 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P01807 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P01807 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P01807 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P01807 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P01807 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P01807 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
P01807 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P01807 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
P01807 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
P01807 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
P01807 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P01807 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P01807 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P01807 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P01807 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P01807 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P01807 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P01807 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
P01807 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
P01807 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P01807 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P01807 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P01807 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P01807 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
P01807 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P01807 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P01807 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P01807 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P01807 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
P01807 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
P01807 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P01807 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P01807 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P01807 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P01807 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P01807 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
P01807 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P01807 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
P01807 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
P01807 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P01807 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P01807 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P01807 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms