Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01796 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01796 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01796 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01796 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01796 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01796 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01796 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01796 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01796 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01796 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01796 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01796 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01796 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01796 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01796 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01796 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01796 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01796 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01796 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01796 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01796 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01796 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01796 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01796 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01796 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01796 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01796 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01796 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01796 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01796 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01796 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P01796 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01796 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01796 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01796 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01796 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01796 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01796 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01796 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01796 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01796 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01796 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01796 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01796 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01796 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01796 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01796 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01796 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01796 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01796 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01796 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01796 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01796 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01796 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01796 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01796 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01796 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01796 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01796 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01796 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01796 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01796 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01796 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01796 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01796 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01796 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01796 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01796 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01796 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01796 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01796 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01796 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01796 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01796 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01796 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01796 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01796 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01796 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01796 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01796 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01796 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01796 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P01796 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01796 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01796 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01796 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01796 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01796 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01796 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01796 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01796 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01796 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01796 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01796 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01796 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01796 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01796 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01796 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01796 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms