Protein–RNA interactions for Protein: P01587

Csf2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2P01587 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csf2P01587 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csf2P01587 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csf2P01587 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csf2P01587 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csf2P01587 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csf2P01587 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Csf2P01587 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csf2P01587 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csf2P01587 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csf2P01587 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csf2P01587 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csf2P01587 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csf2P01587 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csf2P01587 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csf2P01587 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csf2P01587 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csf2P01587 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csf2P01587 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csf2P01587 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csf2P01587 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csf2P01587 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csf2P01587 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Csf2P01587 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csf2P01587 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csf2P01587 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csf2P01587 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Csf2P01587 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csf2P01587 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csf2P01587 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csf2P01587 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csf2P01587 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csf2P01587 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csf2P01587 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csf2P01587 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csf2P01587 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csf2P01587 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csf2P01587 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Csf2P01587 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csf2P01587 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csf2P01587 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Csf2P01587 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csf2P01587 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csf2P01587 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csf2P01587 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csf2P01587 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csf2P01587 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csf2P01587 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csf2P01587 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Csf2P01587 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csf2P01587 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csf2P01587 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Csf2P01587 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csf2P01587 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csf2P01587 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csf2P01587 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csf2P01587 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Csf2P01587 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csf2P01587 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csf2P01587 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Csf2P01587 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Csf2P01587 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csf2P01587 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csf2P01587 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf2P01587 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf2P01587 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf2P01587 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf2P01587 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csf2P01587 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csf2P01587 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csf2P01587 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csf2P01587 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csf2P01587 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csf2P01587 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csf2P01587 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csf2P01587 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Csf2P01587 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csf2P01587 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csf2P01587 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csf2P01587 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csf2P01587 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csf2P01587 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csf2P01587 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csf2P01587 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.1 ms