Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
FosP01101 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
FosP01101 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,64■■■□□ 2,66
FosP01101 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
FosP01101 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
FosP01101 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
FosP01101 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
FosP01101 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
FosP01101 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,53■■■□□ 2,64
FosP01101 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
FosP01101 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,5■■■□□ 2,63
FosP01101 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
FosP01101 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,41■■■□□ 2,62
FosP01101 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
FosP01101 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
FosP01101 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
FosP01101 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
FosP01101 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
FosP01101 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
FosP01101 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
FosP01101 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,59
FosP01101 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
FosP01101 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
FosP01101 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
FosP01101 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
FosP01101 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
FosP01101 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
FosP01101 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
FosP01101 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
FosP01101 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
FosP01101 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
FosP01101 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
FosP01101 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
FosP01101 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
FosP01101 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
FosP01101 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
FosP01101 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,94■■■□□ 2,54
FosP01101 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
FosP01101 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,92■■■□□ 2,54
FosP01101 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
FosP01101 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,88■■■□□ 2,53
FosP01101 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
FosP01101 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,86■■■□□ 2,53
FosP01101 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
FosP01101 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
FosP01101 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
FosP01101 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
FosP01101 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
FosP01101 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
FosP01101 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
FosP01101 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
FosP01101 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
FosP01101 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
FosP01101 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
FosP01101 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
FosP01101 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
FosP01101 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,52■■■□□ 2,48
FosP01101 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
FosP01101 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
FosP01101 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
FosP01101 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
FosP01101 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
FosP01101 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
FosP01101 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
FosP01101 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
FosP01101 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
FosP01101 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
FosP01101 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
FosP01101 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
FosP01101 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
FosP01101 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,27■■■□□ 2,44
FosP01101 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
FosP01101 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
FosP01101 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
FosP01101 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
FosP01101 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
FosP01101 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
FosP01101 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
FosP01101 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
FosP01101 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
FosP01101 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
FosP01101 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
FosP01101 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
FosP01101 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
FosP01101 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
FosP01101 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
FosP01101 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
FosP01101 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
FosP01101 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
FosP01101 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
FosP01101 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
FosP01101 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
FosP01101 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
FosP01101 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
FosP01101 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
FosP01101 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
FosP01101 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
FosP01101 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
FosP01101 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
FosP01101 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms