Protein–RNA interactions for Protein: P00375

Dhfr, Dihydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhfrP00375 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DhfrP00375 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DhfrP00375 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DhfrP00375 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DhfrP00375 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DhfrP00375 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DhfrP00375 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DhfrP00375 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DhfrP00375 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DhfrP00375 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DhfrP00375 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DhfrP00375 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DhfrP00375 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DhfrP00375 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DhfrP00375 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DhfrP00375 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DhfrP00375 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DhfrP00375 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DhfrP00375 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DhfrP00375 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DhfrP00375 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DhfrP00375 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DhfrP00375 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DhfrP00375 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DhfrP00375 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DhfrP00375 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DhfrP00375 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DhfrP00375 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DhfrP00375 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DhfrP00375 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DhfrP00375 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DhfrP00375 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DhfrP00375 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DhfrP00375 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DhfrP00375 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DhfrP00375 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DhfrP00375 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DhfrP00375 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DhfrP00375 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DhfrP00375 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DhfrP00375 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DhfrP00375 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DhfrP00375 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DhfrP00375 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DhfrP00375 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DhfrP00375 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DhfrP00375 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DhfrP00375 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DhfrP00375 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DhfrP00375 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DhfrP00375 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DhfrP00375 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DhfrP00375 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DhfrP00375 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DhfrP00375 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DhfrP00375 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DhfrP00375 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DhfrP00375 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DhfrP00375 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DhfrP00375 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DhfrP00375 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DhfrP00375 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DhfrP00375 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DhfrP00375 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DhfrP00375 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DhfrP00375 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DhfrP00375 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DhfrP00375 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DhfrP00375 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DhfrP00375 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DhfrP00375 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DhfrP00375 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DhfrP00375 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DhfrP00375 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DhfrP00375 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms