Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GcatO88986 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GcatO88986 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GcatO88986 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GcatO88986 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GcatO88986 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GcatO88986 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GcatO88986 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GcatO88986 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GcatO88986 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GcatO88986 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GcatO88986 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GcatO88986 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GcatO88986 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GcatO88986 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GcatO88986 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GcatO88986 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GcatO88986 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GcatO88986 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GcatO88986 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GcatO88986 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GcatO88986 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GcatO88986 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GcatO88986 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GcatO88986 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GcatO88986 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GcatO88986 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GcatO88986 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GcatO88986 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GcatO88986 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GcatO88986 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GcatO88986 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GcatO88986 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GcatO88986 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GcatO88986 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GcatO88986 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GcatO88986 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GcatO88986 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GcatO88986 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GcatO88986 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GcatO88986 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GcatO88986 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GcatO88986 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GcatO88986 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GcatO88986 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GcatO88986 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GcatO88986 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GcatO88986 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GcatO88986 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GcatO88986 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GcatO88986 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GcatO88986 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GcatO88986 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GcatO88986 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GcatO88986 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GcatO88986 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GcatO88986 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GcatO88986 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GcatO88986 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GcatO88986 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GcatO88986 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GcatO88986 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GcatO88986 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GcatO88986 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GcatO88986 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GcatO88986 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GcatO88986 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GcatO88986 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GcatO88986 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GcatO88986 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GcatO88986 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GcatO88986 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GcatO88986 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GcatO88986 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GcatO88986 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GcatO88986 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GcatO88986 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GcatO88986 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GcatO88986 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GcatO88986 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GcatO88986 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GcatO88986 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GcatO88986 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GcatO88986 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GcatO88986 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GcatO88986 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GcatO88986 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GcatO88986 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GcatO88986 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GcatO88986 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GcatO88986 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GcatO88986 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GcatO88986 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GcatO88986 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GcatO88986 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GcatO88986 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GcatO88986 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GcatO88986 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GcatO88986 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GcatO88986 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms