Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc28a2O88627 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc28a2O88627 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc28a2O88627 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a2O88627 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc28a2O88627 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc28a2O88627 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc28a2O88627 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc28a2O88627 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc28a2O88627 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc28a2O88627 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc28a2O88627 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc28a2O88627 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc28a2O88627 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc28a2O88627 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a2O88627 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc28a2O88627 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc28a2O88627 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc28a2O88627 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc28a2O88627 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc28a2O88627 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc28a2O88627 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc28a2O88627 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc28a2O88627 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc28a2O88627 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc28a2O88627 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc28a2O88627 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc28a2O88627 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc28a2O88627 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc28a2O88627 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc28a2O88627 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc28a2O88627 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc28a2O88627 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc28a2O88627 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc28a2O88627 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc28a2O88627 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc28a2O88627 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc28a2O88627 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc28a2O88627 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc28a2O88627 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc28a2O88627 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc28a2O88627 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc28a2O88627 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc28a2O88627 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc28a2O88627 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a2O88627 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc28a2O88627 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc28a2O88627 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc28a2O88627 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc28a2O88627 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc28a2O88627 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc28a2O88627 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc28a2O88627 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc28a2O88627 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc28a2O88627 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc28a2O88627 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc28a2O88627 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc28a2O88627 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc28a2O88627 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc28a2O88627 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc28a2O88627 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc28a2O88627 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc28a2O88627 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms