Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZfrO88532 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZfrO88532 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZfrO88532 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZfrO88532 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZfrO88532 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZfrO88532 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZfrO88532 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZfrO88532 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZfrO88532 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZfrO88532 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZfrO88532 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZfrO88532 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZfrO88532 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZfrO88532 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZfrO88532 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZfrO88532 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZfrO88532 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZfrO88532 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZfrO88532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZfrO88532 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZfrO88532 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZfrO88532 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZfrO88532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZfrO88532 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZfrO88532 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZfrO88532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZfrO88532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZfrO88532 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZfrO88532 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZfrO88532 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZfrO88532 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZfrO88532 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZfrO88532 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZfrO88532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZfrO88532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZfrO88532 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZfrO88532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZfrO88532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZfrO88532 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZfrO88532 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZfrO88532 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZfrO88532 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZfrO88532 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZfrO88532 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZfrO88532 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZfrO88532 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZfrO88532 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZfrO88532 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZfrO88532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZfrO88532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZfrO88532 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZfrO88532 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZfrO88532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZfrO88532 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZfrO88532 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZfrO88532 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZfrO88532 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZfrO88532 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZfrO88532 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZfrO88532 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZfrO88532 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZfrO88532 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZfrO88532 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZfrO88532 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZfrO88532 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZfrO88532 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZfrO88532 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZfrO88532 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZfrO88532 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZfrO88532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZfrO88532 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZfrO88532 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZfrO88532 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZfrO88532 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZfrO88532 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZfrO88532 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZfrO88532 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZfrO88532 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZfrO88532 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZfrO88532 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZfrO88532 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZfrO88532 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZfrO88532 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZfrO88532 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms