Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capns1O88456 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capns1O88456 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capns1O88456 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capns1O88456 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capns1O88456 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capns1O88456 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capns1O88456 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capns1O88456 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capns1O88456 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Capns1O88456 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capns1O88456 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capns1O88456 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns1O88456 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capns1O88456 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capns1O88456 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capns1O88456 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capns1O88456 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capns1O88456 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns1O88456 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capns1O88456 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capns1O88456 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capns1O88456 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capns1O88456 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capns1O88456 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capns1O88456 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capns1O88456 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Capns1O88456 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capns1O88456 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capns1O88456 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capns1O88456 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Capns1O88456 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capns1O88456 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capns1O88456 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capns1O88456 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capns1O88456 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capns1O88456 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capns1O88456 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Capns1O88456 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capns1O88456 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capns1O88456 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capns1O88456 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Capns1O88456 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capns1O88456 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capns1O88456 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capns1O88456 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Capns1O88456 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capns1O88456 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capns1O88456 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capns1O88456 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns1O88456 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns1O88456 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capns1O88456 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns1O88456 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Capns1O88456 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capns1O88456 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns1O88456 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capns1O88456 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capns1O88456 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns1O88456 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns1O88456 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capns1O88456 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capns1O88456 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns1O88456 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capns1O88456 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capns1O88456 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capns1O88456 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capns1O88456 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capns1O88456 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capns1O88456 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns1O88456 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns1O88456 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capns1O88456 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capns1O88456 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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