Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdh16O88338 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdh16O88338 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh16O88338 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdh16O88338 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdh16O88338 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdh16O88338 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh16O88338 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh16O88338 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh16O88338 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdh16O88338 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdh16O88338 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdh16O88338 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdh16O88338 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh16O88338 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh16O88338 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh16O88338 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh16O88338 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh16O88338 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh16O88338 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh16O88338 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh16O88338 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh16O88338 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh16O88338 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh16O88338 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh16O88338 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh16O88338 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh16O88338 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh16O88338 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh16O88338 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh16O88338 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh16O88338 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh16O88338 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh16O88338 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh16O88338 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh16O88338 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh16O88338 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh16O88338 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdh16O88338 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdh16O88338 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdh16O88338 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdh16O88338 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdh16O88338 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdh16O88338 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdh16O88338 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh16O88338 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh16O88338 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh16O88338 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh16O88338 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh16O88338 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh16O88338 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh16O88338 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh16O88338 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh16O88338 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh16O88338 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms