Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Itgb5O70309 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Itgb5O70309 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Itgb5O70309 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Itgb5O70309 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Itgb5O70309 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Itgb5O70309 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Itgb5O70309 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Itgb5O70309 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Itgb5O70309 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Itgb5O70309 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Itgb5O70309 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Itgb5O70309 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Itgb5O70309 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Itgb5O70309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Itgb5O70309 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Itgb5O70309 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Itgb5O70309 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Itgb5O70309 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Itgb5O70309 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Itgb5O70309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Itgb5O70309 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Itgb5O70309 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Itgb5O70309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Itgb5O70309 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Itgb5O70309 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Itgb5O70309 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Itgb5O70309 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Itgb5O70309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Itgb5O70309 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Itgb5O70309 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Itgb5O70309 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Itgb5O70309 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb5O70309 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb5O70309 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Itgb5O70309 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb5O70309 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Itgb5O70309 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Itgb5O70309 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Itgb5O70309 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Itgb5O70309 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Itgb5O70309 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Itgb5O70309 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Itgb5O70309 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Itgb5O70309 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Itgb5O70309 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Itgb5O70309 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Itgb5O70309 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Itgb5O70309 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Itgb5O70309 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Itgb5O70309 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Itgb5O70309 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Itgb5O70309 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Itgb5O70309 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Itgb5O70309 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Itgb5O70309 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Itgb5O70309 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Itgb5O70309 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Itgb5O70309 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Itgb5O70309 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Itgb5O70309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Itgb5O70309 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Itgb5O70309 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Itgb5O70309 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Itgb5O70309 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Itgb5O70309 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Itgb5O70309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Itgb5O70309 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Itgb5O70309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Itgb5O70309 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Itgb5O70309 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Itgb5O70309 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Itgb5O70309 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms