Protein–RNA interactions for Protein: O70300

Pspn, Persephin, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PspnO70300 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PspnO70300 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PspnO70300 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PspnO70300 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PspnO70300 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PspnO70300 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PspnO70300 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PspnO70300 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PspnO70300 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PspnO70300 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PspnO70300 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PspnO70300 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PspnO70300 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PspnO70300 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PspnO70300 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PspnO70300 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PspnO70300 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PspnO70300 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PspnO70300 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PspnO70300 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PspnO70300 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PspnO70300 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PspnO70300 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PspnO70300 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PspnO70300 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PspnO70300 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PspnO70300 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PspnO70300 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PspnO70300 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PspnO70300 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PspnO70300 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PspnO70300 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PspnO70300 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PspnO70300 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PspnO70300 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PspnO70300 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PspnO70300 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PspnO70300 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PspnO70300 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PspnO70300 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PspnO70300 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PspnO70300 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PspnO70300 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PspnO70300 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PspnO70300 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PspnO70300 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PspnO70300 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PspnO70300 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PspnO70300 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PspnO70300 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PspnO70300 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PspnO70300 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PspnO70300 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PspnO70300 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PspnO70300 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PspnO70300 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PspnO70300 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PspnO70300 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PspnO70300 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PspnO70300 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PspnO70300 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PspnO70300 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PspnO70300 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PspnO70300 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PspnO70300 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PspnO70300 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PspnO70300 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PspnO70300 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PspnO70300 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PspnO70300 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PspnO70300 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PspnO70300 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PspnO70300 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PspnO70300 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PspnO70300 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PspnO70300 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PspnO70300 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PspnO70300 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PspnO70300 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PspnO70300 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PspnO70300 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PspnO70300 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PspnO70300 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PspnO70300 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PspnO70300 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PspnO70300 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PspnO70300 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PspnO70300 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PspnO70300 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PspnO70300 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PspnO70300 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PspnO70300 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PspnO70300 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PspnO70300 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PspnO70300 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PspnO70300 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PspnO70300 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PspnO70300 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PspnO70300 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PspnO70300 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms