Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
Gfi1bO70237 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Gfi1bO70237 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Gfi1bO70237 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Gfi1bO70237 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,55■■□□□ 1,2
Gfi1bO70237 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Gfi1bO70237 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Gfi1bO70237 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Gfi1bO70237 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Gfi1bO70237 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Gfi1bO70237 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Gfi1bO70237 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Gfi1bO70237 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Gfi1bO70237 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Gfi1bO70237 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gfi1bO70237 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Gfi1bO70237 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,28■■□□□ 1,16
Gfi1bO70237 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Gfi1bO70237 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
Gfi1bO70237 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
Gfi1bO70237 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Gfi1bO70237 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gfi1bO70237 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gfi1bO70237 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Gfi1bO70237 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,12
Gfi1bO70237 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Gfi1bO70237 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Gfi1bO70237 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,11
Gfi1bO70237 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Gfi1bO70237 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Gfi1bO70237 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Gfi1bO70237 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Gfi1bO70237 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Gfi1bO70237 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Gfi1bO70237 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Gfi1bO70237 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Gfi1bO70237 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Gfi1bO70237 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Gfi1bO70237 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Gfi1bO70237 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Gfi1bO70237 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
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