Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gfi1bO70237 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfi1bO70237 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfi1bO70237 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1bO70237 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfi1bO70237 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfi1bO70237 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfi1bO70237 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfi1bO70237 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfi1bO70237 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfi1bO70237 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfi1bO70237 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1bO70237 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1bO70237 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfi1bO70237 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1bO70237 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfi1bO70237 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfi1bO70237 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfi1bO70237 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gfi1bO70237 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfi1bO70237 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfi1bO70237 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1bO70237 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfi1bO70237 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1bO70237 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfi1bO70237 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfi1bO70237 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfi1bO70237 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gfi1bO70237 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1bO70237 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1bO70237 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1bO70237 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1bO70237 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gfi1bO70237 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfi1bO70237 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfi1bO70237 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfi1bO70237 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfi1bO70237 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfi1bO70237 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfi1bO70237 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfi1bO70237 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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