Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Top3aO70157 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Top3aO70157 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Top3aO70157 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Top3aO70157 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Top3aO70157 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Top3aO70157 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Top3aO70157 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Top3aO70157 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Top3aO70157 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Top3aO70157 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Top3aO70157 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Top3aO70157 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Top3aO70157 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Top3aO70157 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Top3aO70157 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Top3aO70157 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Top3aO70157 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Top3aO70157 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Top3aO70157 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Top3aO70157 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Top3aO70157 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Top3aO70157 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Top3aO70157 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Top3aO70157 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Top3aO70157 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Top3aO70157 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Top3aO70157 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Top3aO70157 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Top3aO70157 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Top3aO70157 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Top3aO70157 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Top3aO70157 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Top3aO70157 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Top3aO70157 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Top3aO70157 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Top3aO70157 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Top3aO70157 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Top3aO70157 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Top3aO70157 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Top3aO70157 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Top3aO70157 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Top3aO70157 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Top3aO70157 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Top3aO70157 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Top3aO70157 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Top3aO70157 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Top3aO70157 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Top3aO70157 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Top3aO70157 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Top3aO70157 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Top3aO70157 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Top3aO70157 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Top3aO70157 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Top3aO70157 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Top3aO70157 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Top3aO70157 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Top3aO70157 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Top3aO70157 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Top3aO70157 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Top3aO70157 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Top3aO70157 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Top3aO70157 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Top3aO70157 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Top3aO70157 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Top3aO70157 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Top3aO70157 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Top3aO70157 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Top3aO70157 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Top3aO70157 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Top3aO70157 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Top3aO70157 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Top3aO70157 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Top3aO70157 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Top3aO70157 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Top3aO70157 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Top3aO70157 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Top3aO70157 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Top3aO70157 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Top3aO70157 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms