Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sept7O55131 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sept7O55131 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sept7O55131 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sept7O55131 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sept7O55131 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sept7O55131 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sept7O55131 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sept7O55131 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sept7O55131 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Sept7O55131 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sept7O55131 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sept7O55131 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sept7O55131 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sept7O55131 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sept7O55131 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sept7O55131 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sept7O55131 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sept7O55131 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sept7O55131 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sept7O55131 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sept7O55131 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sept7O55131 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sept7O55131 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sept7O55131 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sept7O55131 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sept7O55131 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sept7O55131 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sept7O55131 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sept7O55131 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sept7O55131 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sept7O55131 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sept7O55131 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sept7O55131 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sept7O55131 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sept7O55131 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sept7O55131 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sept7O55131 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sept7O55131 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Sept7O55131 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sept7O55131 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sept7O55131 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sept7O55131 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sept7O55131 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sept7O55131 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sept7O55131 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sept7O55131 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sept7O55131 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sept7O55131 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sept7O55131 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sept7O55131 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sept7O55131 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sept7O55131 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sept7O55131 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sept7O55131 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sept7O55131 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sept7O55131 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sept7O55131 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sept7O55131 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sept7O55131 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sept7O55131 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sept7O55131 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sept7O55131 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sept7O55131 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sept7O55131 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sept7O55131 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sept7O55131 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sept7O55131 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sept7O55131 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept7O55131 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept7O55131 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept7O55131 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept7O55131 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sept7O55131 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sept7O55131 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms